Manhattan dankt zijn titel aan het wereldberoemde Manhattan Project, waarmee tijdens de Tweede Wereldoorlog de atoombom werd ontwikkeld. De serie speelt zich af in het Los Alamos (Mexico) van 1943. Daar, in het Los Alamos Laboratorium, werkt een groep van geleerden onder leiding van Dr. Frank Winter (John Benjamin Hickey) aan een vernieuwend implosieontwerp. De rol van Dr. Frank werd daarbij losjes gebaseerd op de historische figuur Seth Neddermeyer. De geleerden opereren in het grootste geheim. De buitenwereld is niet eens op de hoogte van het bestaan van Los Alamos als Mexicaans dorp. De plek staat simpelweg niet op de kaart. En ook de geleerden zelf weten niet meer dan strikt noodzakelijk is, terwijl ze ondertussen ook nog eens voor de zware opdracht staan om hun families te misleiden met betrekking tot die dingen waar ze zelf amper iets van afweten.
Manhattan werd zeer goed onthaald door het Amerikaanse kijkpubliek en gaat straks zijn derde seizoen in. De tv-show werd losjes gebaseerd op de historische werkelijkheid, maar heeft geen pretenties qua historische correctheid. Veel van de echte geleerden die meewerkten aan de ontwikkeling van de atoombom, zoals de Nobelprijs-laureaten Enrico Fermi en Emilio G. Segrè, verschijnen niet in de serie.
