Anne is een coming-of-age verhaal over een buitenstaander die, tegen alle verwachtingen in, en vele uitdagingen, vecht voor liefde en acceptatie en haar plek in de wereld. Het speelt zich af in Prince Edward Island in de late jaren 1890, de serie draait om Anne Shirley (Amybeth McNulty), een jong weesmeisje dat, na mishandeld te zijn in haar jeugd haar tijd heeft doorgebracht in weeshuizen en de huizen van vreemden. Ze wordt door een fout naar een gezin gestuurd met een ouder wordende zus en broer. In de loop van de tijd zal de 13-jarige Anne de levens van Marilla (Geraldine James) en Matthew Cuthbert (R.H. Thomson) en uiteindelijk de hele kleine stad waarin ze leven transformeren met haar unieke geest, felle intellect en briljante verbeeldingskracht.